Oportunidades Públicas

Fecha de Creación Descripción Mentor(es) Acciones
17/12/2025

Experimental Analysis and Modeling of Collective Cancer Cell Migration

This project offers the opportunity to analyze experimental data from a cancer cell migration assay and translate the findings into a computational model, extending an existing Julia-based framework for simulating collective cell migration (see: https://doi.org/10.1039/c5ib00092k; https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905). The student will learn to process and analyze migration data, then implement it within a simulation platform using Julia or Python—modifying and expanding the model, performing parameter sweeps, and exploring how mechanical interactions influence emergent collective behaviors.
We seek motivated and independent students committed to applying computational tools to improve our understanding of cancer progression.
Let me know if you'd like it more specific about the type of migration assay or the analysis steps involved.

Keywords:
Prerequisites:
No prerequisites
Available vacancies:
1/2
Class Code Initials:
PhD students who will assist in mentoring for this research opportunity:
Ignacio Montenegro

This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits

Análisis Experimental y Modelado de la Migración Colectiva de Células Cancerosas

Este proyecto ofrece la oportunidad de analizar datos experimentales de un ensayo de migración de células cancerosas y traducir los hallazgos en un modelo computacional, extendiendo un marco existente basado en Julia para simular la migración colectiva de células (ver: https://doi.org/10.1039/c5ib00092k; https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905). El estudiante aprenderá a procesar y analizar datos de migración, para luego implementarlos dentro de una plataforma de simulación utilizando Julia o Python, modificando y ampliando el modelo, realizando barridos de parámetros y explorando cómo las interacciones mecánicas influyen en los comportamientos colectivos emergentes.
Buscamos estudiantes motivados e independientes, comprometidos con la aplicación de herramientas computacionales para mejorar nuestra comprensión de la progresión del cáncer.

Keywords:
Prerrequisitos:
Sin prerrequisitos
Vacantes disponibles:
1/2
Siglas iniciales:
Estudiantes de doctorado que ayudarán mentoreando en esta investigación:
Ignacio Montenegro

Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos

 		Ver
17/12/2025

Translating a Single-Cell Migration Model from MATLAB to Python

This internship focuses on converting an existing single-cell migration computational model into Python to eliminate dependency on MATLAB licenses. The model follows the framework described in https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905.
The student will translate the model from MATLAB to Python, validate output equivalence between the two platforms, and restructure the code to ensure modularity and extensibility.
Ideal for students with basic programming experience interested in computational modeling for biological questions. Independence, dedication, and motivation to use computation in cancer research are essential.

Keywords:
Prerequisites:
No prerequisites
Available vacancies:
1/2
Class Code Initials:
PhD students who will assist in mentoring for this research opportunity:
Ignacio Montenegro

This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits

Traducción de un Modelo de Migración Celular Individual de MATLAB a Python

Esta práctica se centra en convertir un modelo computacional existente de migración celular individual desde MATLAB a Python, eliminando la necesidad de licencias de MATLAB. El modelo sigue el framework descrito en https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905.
El estudiante realizará la traducción del modelo, validará la equivalencia entre las salidas de MATLAB y Python, y reorganizará el código para que sea modular y fácilmente ampliable.
Es ideal para estudiantes con conocimientos básicos de programación interesados en modelación computacional aplicada a problemas biológicos. Son esenciales la independencia, la dedicación y la motivación por usar herramientas computacionales en investigación sobre cáncer.

Keywords:
Prerrequisitos:
Sin prerrequisitos
Vacantes disponibles:
1/2
Siglas iniciales:
Estudiantes de doctorado que ayudarán mentoreando en esta investigación:
Ignacio Montenegro

Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos

 		Ver
17/12/2025

Building a Multi-Cell Migration Model with Intercellular Interactions

This project aims to develop a new multi-cell computational model from scratch, incorporating intercellular interactions, geometric constraints, and emergent collective dynamics. The conceptual basis draws from https://doi.org/10.1073/pnas.1521151113 and https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905.
The student will design agent-based rules and implement efficient, object-oriented code capable of handling cell–cell forces, boundary constraints, interaction radii, and events such as extrusion or collision avoidance.
Best suited for students with a computational engineering or software background. Biological knowledge is not required; computational rigor, independence, and motivation to contribute to cancer research are essential.

Keywords:
Prerequisites:
No prerequisites
Available vacancies:
2/2
Class Code Initials:
PhD students who will assist in mentoring for this research opportunity:
Ignacio Montenegro

This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits

Construcción de un Modelo Multicelular de Migración con Interacciones Intercelulares

Este proyecto busca desarrollar desde cero un modelo computacional multicelular que incorpore interacciones intercelulares, restricciones geométricas y dinámicas colectivas emergentes. La base conceptual proviene de https://doi.org/10.1073/pnas.1521151113 y https://doi.org/10.1101/2025.08.28.672905.
El estudiante diseñará reglas basadas en agentes e implementará código eficiente y orientado a objetos capaz de manejar fuerzas entre células, límites espaciales, distancias de interacción y eventos como extrusión o evitación de colisiones.
Es una oportunidad ideal para estudiantes con formación en ingeniería computacional o áreas afines. No se requiere conocimiento biológico; sí rigurosidad computacional, independencia y motivación para contribuir a la investigación en cáncer.

Keywords:
Prerrequisitos:
Sin prerrequisitos
Vacantes disponibles:
2/2
Siglas iniciales:
Estudiantes de doctorado que ayudarán mentoreando en esta investigación:
Ignacio Montenegro

Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos

 		Ver
14/07/2026

Nuclear fusion and data analysis for a superconducting reactor

Are you interested in clean energy and data analysis? This project will allow you to work with real data from the EAST tokamak (China), a superconducting fusion reactor that contributes to the global ITER project. You will participate in an international collaboration analyzing emission spectra to study impurity behavior and improve magnetic confinement in the plasma. You will use programming tools in Python and Matlab, along with numerical modeling, to tackle one of the most important challenges in the future of energy.

Keywords:
Prerequisites:
No prerequisites
Available vacancies:
1/1
Class Code Initials:

This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits

Fusión nuclear y análisis de datos de reactor superconductor

¿Te interesa la energía limpia y el análisis de datos? Este proyecto te permitirá familiarizarte y trabajar con datos reales del tokamak EAST (China), un reactor de fusión nuclear superconductor contribuyente al proyecto global ITER. Participarás en una colaboración internacional analizando espectros de emisión para estudiar el comportamiento de impurezas y mejorar el confinamiento magnético del plasma. Utilizarás herramientas de programación en Python y Matlab junto con modelamiento numérico, para abordar uno de los desafíos más importantes de la energía del futuro.

Keywords:
Prerrequisitos:
Sin prerrequisitos
Vacantes disponibles:
1/1
Siglas iniciales:

Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos

 		Ver
Loading…
Loading the web debug toolbar…
Attempt #