Oportunidades Públicas

Fecha de Creación	Descripción	Mentor(es)	Acciones
04/12/2025	Using generative AI for the de novo design of the metamorphic domain of RfaH in its autoinhibited state The metamorphic protein RfaH is a bacterial virulence factor, which has two domains: NTD and CTD. The CTD reversible interconverts from an alpha-helical into a beta-barrel state through a metamorphic process. Although the possible folding routes between both states have been studied, it is unknown if there are other alternatives of folding topologies for the CTD in the autoinhibited state. In this regard, the use of generative AI tools for de novo protein structure design, such as RFDiffusion, allow to explore novel structures never seen in nature. The purpose of this research is, therefore, to ascertain if RFDiffusion allows to generate novel structures for the CTD of RfaH in the autoinhibited state, as well as analyzing the diversity of generated structures via clustering methods based on structural superposition metrics. Keywords: ingeniería proteínas Proteínas inteligencia artificial Prerequisites: No prerequisites Available vacancies: 1/1 Class Code Initials: IBM PhD students who will assist in mentoring for this research opportunity: Camila Neira-Mahuzier, Jorge González-Higueras This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits Uso de IA generativa para el diseño de novo del dominio metamórfico de RfaH en su estado autoinhibido La proteína metamórfica RfaH es un factor de virulencia bacteriano, el cual cuenta con dos dominios: NTD y CTD. El CTD cambia reversible desde un estado de alfa-hélice a un barril beta mediante un proceso metamórfico. Si bien se han estudiado las posibles rutas de plegamiento reversible entre ambos estados, se desconoce si es que existen otras topologías de plegamiento alternativas para el CTD en el estado autoinhibido. En esta línea, el uso de herramientas de IA generativa para diseño de novo de estructuras de proteínas, como RFDiffusion, permiten explorar nuevas estructuras nunca antes vistas en la naturaleza. El propósito de esta investigación es, por lo tanto, verificar si RFDiffusion permite generar nuevas estructuras para el CTD de RfaH en el estado autoinhibido y analizarla diversidad de estructuras generadas mediante métodos de agrupamiento basados en métricas de superposición estructural Keywords: ingeniería proteínas Proteínas inteligencia artificial Prerrequisitos: Sin prerrequisitos Vacantes disponibles: 1/1 Siglas iniciales: IBM Estudiantes de doctorado que ayudarán mentoreando en esta investigación: Camila Neira-Mahuzier, Jorge González-Higueras Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos	César Antonio Ramírez Sarmiento	Ver
04/12/2025	Protein extract from algae based on eutectic solvents The objective of the project is to design an optimized and sustainable protein extraction process from Chilean marine algae using deep eutectic solvents (DES) to produce functional extracts for application in the food industry. Algae species will be selected based on their protein content and cultivation feasibility, followed by nutritional and techno-functional characterization of the extracts, ultimately validating their incorporation into food matrices. Keywords: Proteínas Algas solventes verdes Prerequisites: No prerequisites Available vacancies: 1/5 Class Code Initials: IIQ PhD students who will assist in mentoring for this research opportunity: Javiera Molina This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits Extracto protéico de algas en base a solventes eutécticos El objetivo del proyecto es diseñar un proceso de extracción de proteínas optimizado y sustentable a partir de algas marinas chilenas, utilizando solventes eutécticos profundos (DES), para generar extractos funcionales aplicables en la industria alimentaria. Se seleccionarán las especies de algas según su contenido proteico y viabilidad de cultivo, y se realizará una caracterización nutricional y tecno funcional de los extractos, para finalmente validar su incorporación en matrices alimentarias. Keywords: Proteínas Algas solventes verdes Prerrequisitos: Sin prerrequisitos Vacantes disponibles: 1/5 Siglas iniciales: IIQ Estudiantes de doctorado que ayudarán mentoreando en esta investigación: Javiera Molina Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos	Roberto Iván Canales Muñoz Nicolas Felipe Gajardo Parra	Ver
03/01/2026	Implementation of a Sensory Panel Training Methodology for the Evaluation of Plant-Protein-Based Food Products The growing development of plant-protein-based food products requires specialized sensory methodologies that enable accurate and reproducible evaluation of attributes affecting consumer acceptance. This initiative proposes the implementation and validation of a standardized sensory panel training methodology for plant-based products, addressing key challenges such as off-flavor perception, texture characterization, and hedonic attributes. The opportunity is embedded within a FONDEF initiative focused on novel protein sources for food applications in Chile, contributing to the development of specialized sensory capabilities with strong potential for technological transfer. Keywords: panel sensorial proteinas vegetales Prerequisites: No prerequisites Available vacancies: 1/1 Class Code Initials: IIQ This opportunity uses a Nota 1-7 evaluation method and is worth 10 credits Implementación de una metodología de entrenamiento para panel sensorial en la evaluación de alimentos elaborados con proteína El desarrollo creciente de alimentos elaborados a partir de proteínas vegetales exige metodologías sensoriales específicas que permitan evaluar de manera precisa y reproducible los atributos sensoriales relevantes para la aceptabilidad del consumidor. Esta iniciativa propone la implementación y validación de una metodología estandarizada de entrenamiento para paneles sensoriales aplicada a productos plant-based, abordando desafíos comunes como percepción de off-flavors, caracterización de textura y atributos hedónicos. La oportunidad se desarrolla en el marco de un proyecto FONDEF orientado al uso de nuevas fuentes de proteínas en aplicaciones alimentarias en Chile, contribuyendo a fortalecer capacidades sensoriales especializadas con alto potencial de transferencia tecnológica. Keywords: panel sensorial proteinas vegetales Prerrequisitos: Sin prerrequisitos Vacantes disponibles: 1/1 Siglas iniciales: IIQ Tiene un método de evaluación Nota 1-7, con 10 créditos	Wendy Verónica Franco Melazzini María Carolina Moreno Constenla	Ver